MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 3852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187076	GTAA	2	8	55	62	50 %	25 %	25 %	0 %	409248905
2	NT_187076	CGC	2	6	149	154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248905
3	NT_187076	CCAG	2	8	278	285	25 %	0 %	25 %	50 %	409248905
4	NT_187076	GGC	2	6	303	308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248905
5	NT_187076	GCA	2	6	320	325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248905
6	NT_187076	AAG	2	6	350	355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248905
7	NT_187076	GAC	2	6	368	373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248905
8	NT_187076	CCA	3	9	461	469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248905
9	NT_187076	TCG	2	6	512	517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248905
10	NT_187076	ATT	2	6	609	614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248905
11	NT_187076	GTTCA	2	10	672	681	20 %	40 %	20 %	20 %	409248905
12	NT_187076	GGC	2	6	699	704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248905
13	NT_187076	GCC	2	6	741	746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248905
14	NT_187076	CG	3	6	823	828	0 %	0 %	50 %	50 %	409248905
15	NT_187076	TGA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248905
16	NT_187076	AAT	2	6	870	875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248905
17	NT_187076	CTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248905
18	NT_187076	AGCG	2	8	922	929	25 %	0 %	50 %	25 %	409248905
19	NT_187076	CCG	2	6	1034	1039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248905
20	NT_187076	TGG	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248905
21	NT_187076	TCA	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248905
22	NT_187076	TGCTT	2	10	1238	1247	0 %	60 %	20 %	20 %	409248906
23	NT_187076	GCA	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248906
24	NT_187076	CT	3	6	1267	1272	0 %	50 %	0 %	50 %	409248906
25	NT_187076	GAC	2	6	1302	1307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248906
26	NT_187076	GCT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248906
27	NT_187076	GCA	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248906
28	NT_187076	CAG	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248906
29	NT_187076	CGT	2	6	1467	1472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248906
30	NT_187076	GAC	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248906
31	NT_187076	ACC	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248906
32	NT_187076	AAT	2	6	1667	1672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248906
33	NT_187076	ATT	2	6	1717	1722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248907
34	NT_187076	TGCTTA	2	12	1782	1793	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409248907
35	NT_187076	GTG	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248907
36	NT_187076	TTG	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248907
37	NT_187076	TGC	2	6	1947	1952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248907
38	NT_187076	CTT	2	6	1962	1967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248907
39	NT_187076	ATT	2	6	1995	2000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248907
40	NT_187076	GTC	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248907
41	NT_187076	CG	5	10	2062	2071	0 %	0 %	50 %	50 %	409248907
42	NT_187076	ATG	2	6	2076	2081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248907
43	NT_187076	CGT	2	6	2089	2094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248907
44	NT_187076	GCG	2	6	2099	2104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248907
45	NT_187076	TGCCGA	2	12	2208	2219	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248907
46	NT_187076	TGA	2	6	2229	2234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248907
47	NT_187076	ATT	2	6	2262	2267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248907
48	NT_187076	GCC	2	6	2282	2287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248907
49	NT_187076	CGCA	2	8	2306	2313	25 %	0 %	25 %	50 %	409248907
50	NT_187076	GGA	2	6	2356	2361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248907
51	NT_187076	GCG	2	6	2381	2386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248907
52	NT_187076	CG	3	6	2434	2439	0 %	0 %	50 %	50 %	409248907
53	NT_187076	GCG	2	6	2493	2498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248907
54	NT_187076	TGG	2	6	2508	2513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248907
55	NT_187076	ATG	2	6	2552	2557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248907
56	NT_187076	TGA	2	6	2568	2573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248907
57	NT_187076	GCTGGC	2	12	2584	2595	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248907
58	NT_187076	CGG	2	6	2697	2702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248907
59	NT_187076	GCG	2	6	2706	2711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248907
60	NT_187076	CGG	2	6	2718	2723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248907
61	NT_187076	ACG	2	6	2750	2755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248907
62	NT_187076	GA	3	6	2883	2888	50 %	0 %	50 %	0 %	409248907
63	NT_187076	GTC	2	6	2951	2956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248907
64	NT_187076	AAT	2	6	2993	2998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248907
65	NT_187076	AGG	2	6	3027	3032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248907
66	NT_187076	AGGT	2	8	3105	3112	25 %	25 %	50 %	0 %	409248907
67	NT_187076	CTT	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248907
68	NT_187076	GAT	2	6	3200	3205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248907
69	NT_187076	TCA	3	9	3282	3290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248907
70	NT_187076	GC	3	6	3291	3296	0 %	0 %	50 %	50 %	409248907
71	NT_187076	TGT	2	6	3352	3357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248907
72	NT_187076	GCG	2	6	3363	3368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248907
73	NT_187076	GCA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248907
74	NT_187076	GAG	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248907
75	NT_187076	GCG	2	6	3470	3475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248907
76	NT_187076	CT	3	6	3549	3554	0 %	50 %	0 %	50 %	409248908
77	NT_187076	TGA	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248908
78	NT_187076	GCG	4	12	3579	3590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248908
79	NT_187076	GCT	2	6	3605	3610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248908
80	NT_187076	TGG	2	6	3634	3639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248908
81	NT_187076	CCA	2	6	3644	3649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248908
82	NT_187076	GGC	2	6	3677	3682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248908
83	NT_187076	GGC	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248908
84	NT_187076	TAT	2	6	3736	3741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248908
85	NT_187076	GGC	2	6	3749	3754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248908
86	NT_187076	GCC	2	6	3795	3800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248908
87	NT_187076	AATT	2	8	3844	3851	50 %	50 %	0 %	0 %	409248908
88	NT_187076	GTC	2	6	3900	3905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248908
89	NT_187076	GCG	2	6	3924	3929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248908
90	NT_187076	TGG	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248908
91	NT_187076	GATTTT	2	12	3989	4000	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	409248908
92	NT_187076	CGG	2	6	4003	4008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248908
93	NT_187076	TGA	2	6	4018	4023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248908
94	NT_187076	CGC	2	6	4056	4061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248908
95	NT_187076	ACG	2	6	4087	4092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248908
96	NT_187076	ATC	2	6	4104	4109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248908
97	NT_187076	CAG	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248908
98	NT_187076	CAG	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248908
99	NT_187076	GC	3	6	4146	4151	0 %	0 %	50 %	50 %	409248908
100	NT_187076	GCT	2	6	4238	4243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248908
101	NT_187076	TTG	2	6	4275	4280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248908
102	NT_187076	ACC	2	6	4380	4385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248908
103	NT_187076	CAG	2	6	4401	4406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248908
104	NT_187076	ATTGAT	2	12	4497	4508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409248908
105	NT_187076	CGA	2	6	4529	4534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248908
106	NT_187076	TGG	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248908
107	NT_187076	TTA	2	6	4632	4637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248908
108	NT_187076	GA	3	6	4684	4689	50 %	0 %	50 %	0 %	409248908
109	NT_187076	CT	3	6	4694	4699	0 %	50 %	0 %	50 %	409248908
110	NT_187076	ATC	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248908
111	NT_187076	GC	3	6	4851	4856	0 %	0 %	50 %	50 %	409248908
112	NT_187076	TGGCGC	2	12	4930	4941	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248908
113	NT_187076	TGA	2	6	4976	4981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248908
114	NT_187076	CAG	2	6	5022	5027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248908
115	NT_187076	GGC	2	6	5033	5038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248908
116	NT_187076	CAC	2	6	5051	5056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248908
117	NT_187076	TGG	2	6	5059	5064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248908
118	NT_187076	CAA	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248908
119	NT_187076	GGC	2	6	5162	5167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248908
120	NT_187076	AGTT	2	8	5200	5207	25 %	50 %	25 %	0 %	409248908
121	NT_187076	GAG	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248908
122	NT_187076	GCC	2	6	5220	5225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248908
123	NT_187076	GAA	2	6	5235	5240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248908
124	NT_187076	CAT	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248909
125	NT_187076	CGT	2	6	5298	5303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248909
126	NT_187076	TTTC	2	8	5312	5319	0 %	75 %	0 %	25 %	409248909
127	NT_187076	CGC	2	6	5356	5361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248909
128	NT_187076	CTCG	2	8	5376	5383	0 %	25 %	25 %	50 %	409248909
129	NT_187076	GGA	2	6	5509	5514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248910
130	NT_187076	TTC	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248910
131	NT_187076	CGCGG	2	10	5609	5618	0 %	0 %	60 %	40 %	409248910
132	NT_187076	CGA	2	6	5668	5673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248910
133	NT_187076	ATC	2	6	5696	5701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248910
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254	NT_187076	CAC	2	6	12414	12419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248918
255	NT_187076	CGA	3	9	12431	12439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248918
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258	NT_187076	TTAT	2	8	12766	12773	25 %	75 %	0 %	0 %	409248918
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263	NT_187076	T	6	6	12878	12883	0 %	100 %	0 %	0 %	409248918
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388	NT_187076	A	7	7	19261	19267	100 %	0 %	0 %	0 %	409248923
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